开封市农业生物育种重点实验室是依托于开封市农林科学研究院的市级重点实验室，在2006年经开封市科学技术局批准成立的。
重点实验室坚持“开放、流动、联合、竞争”运行机制，运用共建共享的机制，购置满足农业科研使用的仪器和设备，成为我院农业科研应用基础研究的科研阵地，同时，也为开封市所有涉农科研单位、技术推广单位提供了一个横向联合的研究平台。
分子生物学实验室主要从事农作物功能基因组学和蛋白组学研究，阐释农作物基因的功能，研究基因间互作、信号转导方面的内容，主要以基础研究为主，为作物分子辅助育种打下坚实基础。现有超速离心机、高速离心机、不同规格的台式离心机、组织破碎仪、基因扩增仪、PCR仪、电泳仪、凝胶成像系统、纯水仪、植物培养箱等仪器设备。
农作物的品质分析，测定农作物各种营养成分含量、外观品质的分析，为品质育种提供实验指导。如：凯式定氮仪、近红外谷物分析仪、荧光倒置显微镜、种子发芽培养箱等。
作物遗传育种实验室主要围绕选育高产、优质、多抗农作物新品种的需要,充分利用作物种质资源,染色体工程、细胞工程、群体改良、轮回选择、品种间杂交、远缘杂交等技术手段,选育出符合农业生产发展的新品种(组合)在生产上应用。本室主要仪器设备有PCR仪、超低温冰箱、植物生长箱、超净工作台、生物安全柜、测糖仪、水浴锅、紫外分光光度计、液氮罐等仪器设备，还配备有规范严格的组织培养室。
现阶段开展的研究主要有：1、花生高油酸基因FADZA/B的序列对比，开农系列高油酸花生遗传差异分析，3、全国高油酸花生指纹图谱构建，利用SSR标记鉴定F1真伪杂种，4、西瓜秋水仙素诱变纯合四倍体西瓜等。
开封市农业生物育种实验室2016年通过综合评估被评为开封市优秀重点实验室，2019年被评为开封市良好重点实验室。
